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1945年10月8日，增田知貞從哈爾濱回到東京。審訊取得了很大的進展，開始摸到部隊的核心部分。之所以這樣說，是因為增田是石井四郎的心腹，如果日本沒有戰敗的話，繼石井、北野之後，他會成為731部隊的第三代部隊長，是一個了不起的幹部。10月9日，增田在接受桑德斯審訊時交代說，&ldo;在731部隊秘密地進行細菌戰的研究&rdo;，&ldo;研究攻擊性細菌戰的部門為了保密，相互之間是不能進行協作的&rdo;。從增田的經歷來看，在軍醫學校任教官（1931-1932年，1941-1943年）和在731部隊（1937-1939年，1945年4月至戰爭結束）工作，是交叉在一起的，說明平房的部隊和東京的軍醫學校之間有著極為密切的關係。由於增田患急性瘧疾，使第一次審訊陷於中斷。三天以後的10月11日和16日又進行了審訊。增田本人吹牛說：&ldo;只有石井和我，才瞭解有關細菌戰活動的全貌。&rdo;（10月8日）增田的口供成了&ldo;桑德斯報告&rdo;的核心。也就是說，他詳細地供述了在平房用於實驗的病原體種類、培養基、大量生產的方法、生存能力的研究、水井汙染、動物實驗、細菌噴霧（煙霧劑）、從飛機上直接撒佈以及部隊感染事故等有關情況和在實驗中使用的病原體腸傷寒菌、副傷寒菌、赤痢菌、霍亂菌、鼠疫菌、炭疽菌、馬鼻疽菌、破傷風菌等，以及在炸彈的野外實驗中，使用了靈菌和炭疽菌兩種等情況。另外，還供認在炭疽菌的研究中，兩年內共使用了100匹馬、500隻羊。他初次供稱，平房的研究費，1944年度為600萬日元；部隊人員數1939-1940年期間，最大規模時多達3000人，1945年部隊崩潰之前為1500人。這樣，於11月1日提出了&ldo;桑德斯報告&rdo;。

&ldo;桑德斯報告&rdo;總結了上述兩個月審訊的情況。報告說，細菌戰的中心機關設於平房，最多時擁有3000名部隊人員，其重點放在製造實戰用的細菌武器，研究過8種特殊炸彈，尤其徹底研究了&ldo;宇治&rdo;型炸彈，曾在野外進行過2000多枚的實驗。但是，在這裡沒有交代在安達進行野外活體實驗的事實；同時，報告的&ldo;結論&rdo;中認為，日本細菌戰計劃未能製造出實用武器，而且還指出，即使手中掌握了細菌、化學武器，但由於擔心美國用細菌、化學武器進行報復，所以，沒有用於攻擊（作戰）。

桑德斯生病回國以後，盟軍總司令部查到了潛伏在千葉縣的石井四郎，把他帶到東京。1945年底至1946年初，石井和盟軍總司令部之間進行交易（所謂&ldo;鎌倉會議&rdo;），以換取細菌戰情報為條件，盟軍司令部免除731部隊有關人員的戰犯罪責。關於這件事，石井本人曾向若干人說過。免除戰犯罪責一事，早在1945年秋麥克阿瑟、威洛比和桑德斯三人就巳做出決定。桑德斯在接受記者採訪，回答&ldo;你是否知道免除戰犯罪責的交易&rdo;的提問時說：&ldo;是的，那是1945年秋天，我和盟軍總司令部的上司威洛比少將進行商談之後，兩人一起來到了總司令辦公室。我們坐在麥克阿瑟兩旁。我清楚地記得當時交談的內容。威洛比說，如果不保證不追究他們的戰犯責任，就不能順利地查明731部隊的情況，是否可以由桑德斯中校出面做出這一保證呢？麥克阿瑟回答說：&l;可以這樣做。&r;威洛比問：&l;桑德斯中校可以說是您的意思嗎？&r;麥克阿瑟（默不作聲地點了點頭）。&rdo;為了接辦桑德斯的調查工作，底特律克堡的阿沃&iddot;湯普森來到日本。他從1946年1月11日起至3月11日為止，進行了兩個月的調查。這就是第二次調查。湯普森的調