第拾點伍話：補完貳、預熱(第2/3 頁)

用了啊，其他量產機也完全廢掉，適格者們也因核爆而休眠。EVA核心保留著，但這種東西NERV根本不惜得要。0，1，2三臺機器倒是還可以駕駛，但是需要進行修理。那邊，SELLE搞內鬥，碇源堂成功地把其他留有本體的SELLE老人幹掉，又關閉了基路（注意，只是暫時登出，實際上沒有真正消滅），想一人用自己的方式完成人類補完計劃（然而結果失敗）

第二話：培養皿計劃，獻祭2-A全班來完成補完計劃（？）。新規角色長瀨裕樹，千翼，惟由，水澤悠（名字均來源於《假面騎士Amazons》）其實就一工具人，展示培養皿計劃的而已，至於女神是明日香這個設定，挺正常的吧，反正以後這角色不會出現了。2-A班的同學在執行完培養皿計劃後全部死亡了嗎？沒有。

第三到十話：三到十話為連續性故事，也就是100時時間（靈感來源於REALxtImE），一個疑似渚薰的使徒以倒計時的方式出現在日本上空，也不說倒計時後要幹什麼，真希波駕駛福音飛翼前往偵查。“渚薰”在意識中和真嗣談話，告訴他自己的意圖，但此時的真嗣因為對世界充滿希望而拒絕了渚薰。NERV那邊把新的使徒歸類為新十七使徒（他們假設使徒是一個物種且存在同類），名稱為體天使，體天使自己給自己取名為佚者（此為補充設定）真嗣在駕駛初號機前回憶了一段故事：其實真嗣心思很縝密，在NERV各處安裝了竊聽器之類的東西（NERV裡這種東西多了去了，要不然加持也不能臥底這麼長時間），在11月末，真嗣透過觀察竊聽資料知道了所謂人類補完計劃、莉莉絲這類東西。在第一卷序的“真嗣探病”那晚，真嗣也不是專注於幹正事，順便把mEm細胞（原創設定：利用該細胞可以觀察宿主近期的身體和精神變化情況）注入了明日香體內，並在12月5日看到了明日香偽補完的場面，也就是在此時，真嗣的心態發生轉變，真正學會陽光面對生活，但還是覺得昨晚自己太過不理智（指對式波直球表白），並和式波保持距離。體天使慢慢喚出了其他使徒，初號機打不了車輪戰，戰勝小力後被小水和晝天使撂倒，此時的恐怖天使也復甦，在初號機機體內進化繁衍，大家發現所有的使徒都復甦了，基路也順便揭露了補完的真相。但大家都對此不是感到十分震撼，美里開始和律子演戲，在其他人搬離NERV1部是在NERV1部裡制定反叛計劃（既建立wILLE）。

因為其他駕駛員還沒甦醒，似乎人類方沒有戰鬥力，但時田士郎（JA專案的領導人）來了，派出JA改來與使徒作戰，效果拔群，順便接替美里獲得指揮權！同時，為了防止恐怖天使進一步蔓延，時田創造性的提出“用啟動傀儡系統來殺死恐怖天使”，事實證明，他的猜想是對的，JA改去其他地方消滅使徒，傀儡化初號機開始和獸化的被霰天使附身的浪人開始打架，但因先行官的“庇護效應”，所以打了幾個點都難分勝負，唯的靈魂也無法直接操控初號機。

又是最喜歡的一集！在休眠期間，式波和在補完後的心靈世界裡的明日香對話，式波告訴了明日香，只有明日香能救真嗣，讓明日香走出這個虛幻的美好世界，跳出這個虛假的補完，勇敢面對現實，然後明日香就解除了休眠，以惣流·明日香·蘭格蕾的人格回來（不出意外的話式波只能存在於內心世界，在現實生活中不可能再出來了）為了防止傀儡系統中的初號機誤傷二號機，律子解除初號機的傀儡系統，真香再一次共戰！（好好好）二人合力擊敗5號機，又共同擊敗音樂使徒，然後就剩下中國境內的子宮天使，美國境內的鳥天使和太空中的空天使，JA改被派去作戰，真嗣和明日香二人可以在家休息。

又是最喜歡的一集！綾波麗在休眠期自我思考，綾波因看到了人們不同的情感，也想成為人類，於是腦補出一個