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關於科學與宗教，本書所討論的問題並不限於此。作者還想表達更深層的東西，這種東西集中體現在第二部分&ldo;要有光&rdo;中學者塔和保羅師的爭論之中。其核心就是：科學與宗教，在人類的發展過程中，各自應該起到什麼樣的作用。

作者透過學者塔之口表述說，科學只是一種工具，科學工作者們的任務只是發展這種工具，至於如何使用，用於何處，完全依靠人類自己選擇;但作者也透過保羅師之口批判了這一觀點，他尖銳地指出，科學家們必須承擔自己應該承擔的，不能將自己的責任推卸給其他人，想要&ldo;洗淨自己的雙手&rdo;是不可能的。

可惜的是，如何承擔這一責任，作者也沒能找到什麼好方法。作者承認，這一責任無論是對於一個人、一個教派、甚至是一個種族，都顯得過於沉重了。所以在全書的最後一部分，他還是隻能讓再次輝煌的人類文明重新經歷全面崩潰的過程‐‐因為他看不到出路。

五、出路

我毫不懷疑，對自然資源的無限利用、對自身力量的無限追求，最終將會把人類帶入滅亡的境地。但是我們為什麼會有這樣的慾望?科學本身只是一件中性的工具，為什麼會被越來越多的指責為人類諸多頑症的禍首?

我想，其根源還是在於西方的文化傳統。自培根提出&ldo;把自然鎖住&rdo;以來，西方的科學研究一直致力於如何充分利用自然來滿足人類自身的需要，在那之中完全看不到東方哲學所蘊含的生生不息、天人合一的思想。這是西方得以迅速崛起的原因，也恰恰是如今諸多問題的根源。

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